肝癌的预后需要强调的是统计数字是基于大量病人的平均水平。在应用到每个患者时很难做到准确预测。没有两个人的病情是完全一样的，每个患者对同样的治疗的反应也各不相同。与许多其它类型的癌症一样，预后取决于癌症诊断时的阶段，也就是说癌症的分期。 这里的数字涉及成人原发性肝癌。小儿原发性肝癌非常罕见，但儿童的预后也比成人更好。成年人的肝癌的预后不好，因为大多数癌症在确诊时已经处于晚期阶段。当有症状去找医生的时候，这种疾病很多时候已经处于晚期阶段。仅有约10%的患者能在早期阶段发现，可以进行手术治疗。 总体而言，大约20%的人在诊断后存活至少1年。约5%的人存活至少5年。 很多肝癌患者同时有肝硬化，肝硬化是由感染或长期酗酒引起的。不幸的是，在这种情况下不能采用手术治疗(除非肿瘤很小)，将近一半以上的患者生存时间不超过3个月。很少有患者能生存超过一年。 其它可能影响预后的因素除了癌症所处的阶段，其它因素也可能会影响预后。 其它因素可能影响对肝癌的治疗。最重要的是如果不受癌症影响的健康的肝组织受到损害，例如肝硬化，患者将不太可能接受手术治疗。如果癌症已侵入肝脏的主要血管，特别是肝门静脉，这也将影响治疗。
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