肛门是身体中大肠向身体外面的开口部分，它是排空肠道时使粪便通过的管道。肛管长约3厘米，它位于直肠末端。肛门的下半部分称为肛门边缘，肛门边缘包含肛门括约肌，肛门外括约肌是用来控制大便的肌肉。
覆盖肛管的内膜是由鳞状细胞组成的，绝大多数肛门癌是鳞状细胞癌。
肛管与直肠交汇的区域称为过渡区，这里的肛门内膜是由鳞状细胞和腺细胞组成的。腺体细胞分泌的粘液可帮助粪便顺利的通过肛门，医生称这一带为齿状线。一种罕见的称为肛门腺癌的肛门癌会发生于这些腺体细胞。
