肛门癌主要的治疗方法是化疗和放射治疗，患者有时也应用放疗和化疗的组合治疗。如果癌症复发或在放化疗后没有完全消失，患者将需要手术。下面讲述了最常见的肛门的鳞状细胞癌的治疗。肛门腺癌的治疗方式与直肠腺癌的治疗方式相同，如果需要了解肛门腺癌的治疗方式，请阅读直肠癌的治疗章节。
医生根据以下因素决定对患者采取哪种治疗方式：
·癌症的类型和大小
·肛门受影响的部分
·患者的一般健康状况
·癌症是否已经扩散
·放射治疗
·化疗
·放化疗
·手术治疗
